环境工程硕士学科于 2006 年获得国务院学位委员会授权，2007 年在能动学院和化工学院开始招收全日制硕士研究生，2014 年改为能动学院单独招生。本学科的建立，是在我国社会经济快速发展，环境恶化、资源匮乏、能源危机等一系列人与环境的矛盾愈加突出的大环境下，国家的经济发展和生态环境保护迫切需要一大批具备基础理论扎实、专业知识全面以及具有认识和解决复杂环境问题能力的复合型人才队伍的形势下应运而生的。本学科以国内外及自治区存在的重大生态环境问题为导向，瞄准制约区域社会、经济、资源和生态环境可持续发展的关键理论和技术难题，依托我校“内蒙古自治区可再生能源重点实验室”以及“环境工程”和“环境科学”两个本科专业，培养出了一大批具有认识和解决复杂环境问题初步能力，能够从事科学研究工作或具有担负专门技术工作能力的、具有良好科研道德和敬业精神的复合型人才。目前已在污染物控制技术与工程、环境材料、膜科学技术与新源、环境生物技术与应用等方面确立了稳定的研究方向，形成了与自治区工业发展密切结合、具有鲜明研究特色的学科。

   本学科师资学历结构合理，学术骨干具有较高的学术水平，聘请的校外兼职导师来自工业生产第一线。目前具有博士生导师 1 人（草原英才），硕士生导师 13 人。其中具有博士学位教师 13 人。先后于 2016 年获批自治区高等学校“创新团队发展计划”，于 2014 年获批“水污染控制与水资源综合利用创新团队”，于 2013 年获准“环境科学与环境工程硕士学科建设与培育项目”。近五年，获批各级各类科研项目 45 项，其中国家自然科学基金项目 8 项，省部级科研项目 20 项，省级研究生科研创新项目 1 项，校级科研项目 15 项，校级教改项目 5 项，校级教材建设项目 1 项，横向科研项目 9 项，科研项目到校经费 712 万元；获各级各类奖项 6 项，其中教育部 2017 年高等学校科学研究科学技术一等奖 1 项，内蒙古自治区自然科学一、三等奖各 1 项，内蒙古工业大学教学成果三等奖 1 项，优秀研究生国家奖学金 1 人次，校级“优秀硕士学位论文奖”1 人次，校级优秀教学质量奖 1 人次；获国家专利 7 项，其中发明专利 4 项，实用新型专利 3 项。2013～2017 年，发表研究论文 117 篇，其中被 SCI、EI 等三大检索收录 47 篇，中文核心收录 46 篇。2013～2017 年，培养“环境工程”工学硕士学位研究生 41 名，其中获校级“优秀毕业生” 2 名；截止 2017 年底，在读“环境工程”硕士研究生 26 名。